Mazda6睿翼了采用新开发的MZR 2.5L发动机代替此前的MZR 2.3L发动机。该发动机在尺寸和重量上与2.3L发动机基本相同，但力求在技术细节和动力表现上有所突破。
2.5L发动机装配了S-VT连续可变气门正时控制系统、VTCS可变涡流控制系统、VAD可变进气道、电子控制节气阀，实现了高动力输出和即时响应的平衡。MZR2.5L的输出功率比2.3L提升了10%。而且2.5L发动机的VIS可变进气歧管系统通过实时调整进气的有效冲程对加速过程中高扭矩下的进气效率进行了优化。
此外，MZR 2.5L发动机扩大了气缸内径与冲程，缩小了气缸间距并将活塞轻量化，并通过改善吸排气口的流动性来提高实用区域的扭矩，进而实现更为线性的加速感与精准的响应性能。
在新发动机的助推下，Mazda6睿翼最大输出功率达124kW/6000rpm，在4000转时即可达致226Nm的最大扭矩，同时在低中速域即可发挥出最大扭矩的90%，令驾驶者能够充分体验“起步推背感”与“中高速时的加速感”。
Mazda6睿翼发动机在经济性方面也有很大提升改善。国内各种道路测试的综合油耗仅仅为8.7升。
在油价高涨的背景下，如何能够让发动机更加省油，是所有车主关心的话题。Mazda6睿翼的用油是93号汽油，这也归功于Mazda6睿翼发动机具备高精度的爆震控制系统，同时采用了合适的发动机压缩比。
Mazda6睿翼的爆震控制系统中表现最突出的是动态响应特性极佳的爆震传感器，它有很好的抗干扰能力，并能准确判断是否爆震，以及爆震强度大小，使发动机在期望的轻微爆震的工况下工作，既可以最大限度获得动力性，又避免严重爆震，防止损坏发动机。此外，Mazda6睿翼发动机燃烧室的合理形状及布局，以及优秀的散热力，也减少了爆震发生的可能性。
另外Mazda6睿翼采用了合适的发动机压缩比。压缩比是发动机一个非常重要的结构参数，通常来说压缩比越大，发动机的动力性和经济性越好，但是一味增大压缩比，不但不会提高发动机的性能，而且还会引发爆震，并加剧发动机的磨损，从而使发动机加速无力，工作粗暴，油耗增加，严重时导致发动机损坏。Mazda6睿翼发动机在设计时综合考虑了动力、经济和燃油适应性的问题，优化选择合适的压缩比取得了比较均衡的效果。